RNA BASER 4.36

Lizenz: kostenlos ‎Dateigröße: 1.34 MB
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www.rnaBaser.com Einfach zu bedienende Aligner-Software für die RNA-Sequenzkontierungs-, Contig-Bearbeitung und Mutationserkennung für Windows. Es ist eine molekularbiologische Software, die Sequenzen in Kontasten anzeigen und zusammenstellen kann. Features: Endclip, Exportsequenzen, Baugruppen, Codeerkennung. Beschreibung: RNA Baser ist eine erschwingliche Alternative für die Montage von RNA-Sequenzen und die Erzeugung von Contigs. Unterstützte Dateiformate sind abi, scf und seq (oder FASTA). Chromatogramme der zusammengesetzten Sequenzen werden in einem synchronisierten Format mit dem generierten Kontätskreis angezeigt. Mehrdeutige Basen im Contig werden hervorgehoben und Korrekturen werden von rnaBaser basierend auf Qualitätswerten der Ablaufverfolgungsdateien vorgeschlagen. Minimale Eingabe des Benutzers erforderlich. Das Bearbeiten von mehrdeutigen Basen, einschließlich Einfügen und Löschen, ist möglich. Die Einstellungen des Baugruppenmoduls können vom Benutzer angepasst werden. Der Benutzer kann das Aussehen von Chromatogrammen, Nukleotiden, Hintergrund personalisieren. Die Qualitätswerte der Ablaufverfolgungsdateien werden über Chromatogrammen angezeigt, so dass der Anwender leicht über die Korrekturen im Endkong entscheiden kann. Original-Chromatogrammdateien werden basierend auf Qualitätswerten automatisch getrimmt. Die Contig wird automatisch im FASTA-Format gespeichert, im selben Verzeichnis mit den ursprünglichen Ablaufverfolgungsdateien. Durch die Verwendung einer aufgebauten Datenbank mit Primer- und Vektorsequenzen, die vom Benutzer bearbeitet/aktualisiert werden können, kann rnaBaser so eingestellt werden, dass die Vektorsequenz automatisch aus dem endgültigen Kong entfernt wird. Beschreibung: Einfach zu bedienende Aligner-Software für RNA-Sequenzierungstool, Contig-Bearbeitung und Mutationserkennung für Windows. Es ist eine molekularbiologische Software, die Sequenzen in Kontasten anzeigen und zusammenstellen kann. Features: Endclip, Exportsequenzen, Baugruppen, Codeerkennung. Es ist eine Preisalternative für die RNA-Contig-Montage. Download enden Freeware-Tools für die Dateikonvertierung. trim Vektor Sequenz freie Programm Ausrichtung Ausrichtung Basis konvertieren Konsens Sequenzierung Spur mac os x Fenster Mutation Primer, Echtzeit-PCr-Qualität.

VERSIONSVERLAUF

  • Version 4.36 veröffentlicht auf 2016-10-20
    Batch-Montage. Tausende von Contigs können auf einmal montiert werden.

Programmdetails