Das SourceForge OpenRasMol-Projekt ist eine Ergänzung zum RasMol- und OpenrasMol-Projekt bei http://rasmol.org. Es ist zu hoffen, dass das SourceForge OpenRasMol-Projekt eine praktische Anlaufstelle für aktive kollaborative Beiträge bieten wird. RasMol Eigenschaften: RasMol ist ein molekulares Grafikprogramm zur Visualisierung von Proteinen, Nukleinsäuren und kleinen Molekülen. Das Programm zielt auf die Anzeige, Lehre und Generierung von Publikationsqualitätsbildern ab. RasMol läuft auf einer Vielzahl von Architekturen und Betriebssystemen, einschließlich Microsoft Windows, Apple Macintosh, UNIX und VMS-Systemen. UNIX- und VMS-Versionen erfordern eine 8-, 24- oder 32-Bit-Farb-X-Windows-Anzeige (X11R4 oder höher). Die X Windows-Version von RasMol bietet optionale Unterstützung für eine Hardware-Zifferblätter-Box und beschleunigte Shared Memory-Kommunikation (über die XInput- und MIT-SHM-Erweiterungen), sofern auf dem aktuellen X Server verfügbar. Das Programm liest in einer Molekülkoordinatendatei und zeigt das Molekül interaktiv auf dem Bildschirm in einer Vielzahl von Farbschemata und Moleküldarstellungen. Derzeit verfügbare Darstellungen umfassen Tiefen-Cued-Drahtmodelle, "Dreiding"-Sticks, Spacefilling(CPK)-Kugeln, Kugel und Stick, feste und Strang-Biomolekularbänder, Atombeschriftungen und Punktoberflächen. Die X Windows-Version von RasMol bietet optionale Unterstützung für eine Hardware-Zifferblätter-Box und beschleunigte Shared Memory-Kommunikation (über die XInput- und MIT-SHM-Erweiterungen), sofern auf dem aktuellen X Server verfügbar. Das Programm liest in molekularen Koordinatendateien und zeigt das Molekül interaktiv auf dem Bildschirm in einer Vielzahl von Darstellungen und Farbschemata. Unterstützte Eingabedateiformate sind Protein Data Bank (PDB), Die Alchemie- und Sybyl Mol2-Formate von Tripos Associates, das Dateiformat Mol von Molecular Design Limited (MDL), das XYZ-Format (MSC) des Minnesota Supercomputer Center (MSC), das CHARMm-Format, das CIF-Format und die Dateien im mmCIF-Format. Wenn Keine Verbindungsinformationen in der Datei enthalten sind, wird dies automatisch berechnet. Das geladene Molekül kann als Drahtgitterbindungen, Zylinder-Dreiding-Stickbindungen, Alpha-Kohlenstoff-Spuren, CPK-Kugeln, makromolekulare Bänder (entweder glatt schattierte Festbänder oder Parallelstränge), Wasserstoffbindung und Punktoberflächendarstellungen dargestellt werden. Atome können auch mit beliebigen Textzeichenfolgen beschriftet werden. Alternative Konformatoren und mehrere NMR-Modelle können speziell gefärbt und in Atometiketten identifiziert werden. Verschiedene Teile des Moleküls können unabhängig vom Rest des Moleküls dargestellt und gefärbt oder in mehreren Darstellungen gleichzeitig dargestellt werden. Das angezeigte Molekül kann interaktiv gedreht, übersetzt, gezoomt und z-clipped (slabbed) entweder mit der Maus, den Bildlaufleisten, der Befehlszeile oder einem angeschlossenen Wählfeld gedreht, übersetzt, gezoomt und gezappt werden. RasMol kann eine vorbereitete Liste von Befehlen aus einer 'Skript'-Datei (oder über prozessübergreifende Kommunikation) lesen, damit ein bestimmtes Bild oder ein Ansichtspunkt schnell wiederhergestellt werden kann. RasMol kann auch eine Skriptdatei erstellen, die die Befehle enthält, die zum Regenerieren des aktuellen Bildes erforderlich sind. Schließlich kann das gerenderte Bild in einer Vielzahl von Formaten geschrieben werden, einschließlich Raster oder Vektor PostScript, GIF, PPM, BMP, PICT, Sun Rasterfile oder als MolScript-Eingabeskript oder Kinemage. Die RasMol-Hilfeeinrichtung kann durch Eingabe von "Hilfe" oder "Hilfe
VERSIONSVERLAUF
- Version RasMol_2.7.5 veröffentlicht auf 2010-12-15
Mehrere Korrekturen und Updates - Version RasMol_2.7.5 veröffentlicht auf 2010-12-15
Programmdetails
- Kategorie: Bildung > Andere
- Verlag: www.rasmol.org
- Lizenz: kostenlos
- Preis: N/A
- Version: 2.7.5
- Plattform: linux